Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms