Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms