Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms