Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb1P12658 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms