Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa1P11477 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms