Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP11369 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP11369 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP11369 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PolP11369 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PolP11369 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PolP11369 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP11369 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms