Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P10404 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P10404 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P10404 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P10404 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P10404 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P10404 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P10404 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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