Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms