Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Pde6gP09174 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pde6gP09174 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Pde6gP09174 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Pde6gP09174 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Pde6gP09174 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Pde6gP09174 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Pde6gP09174 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Pde6gP09174 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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