Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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