Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefmP08553 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefmP08553 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NefmP08553 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NefmP08553 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefmP08553 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefmP08553 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefmP08553 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefmP08553 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefmP08553 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefmP08553 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefmP08553 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefmP08553 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefmP08553 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefmP08553 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms