Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spta1P08032 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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