Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtrP07309 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtrP07309 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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