Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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