Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P04212 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P04212 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P04212 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
P04212 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P04212 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P04212 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P04212 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P04212 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
P04212 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P04212 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms