Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01807 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01807 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01807 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01807 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01807 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01807 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01807 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01807 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P01807 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01807 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01807 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01807 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms