Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01664 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01664 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01664 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01664 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01664 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01664 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01664 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01664 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms