Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01652 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01652 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01652 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01652 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01652 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01652 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01652 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01652 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01652 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01652 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01652 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01652 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms