Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms