Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms