Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F11rO88792 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
F11rO88792 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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F11rO88792 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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F11rO88792 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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F11rO88792 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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F11rO88792 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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F11rO88792 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
F11rO88792 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
F11rO88792 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
F11rO88792 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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