Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClppO88696 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClppO88696 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClppO88696 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClppO88696 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClppO88696 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClppO88696 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClppO88696 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClppO88696 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClppO88696 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClppO88696 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClppO88696 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClppO88696 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClppO88696 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClppO88696 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClppO88696 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClppO88696 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClppO88696 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClppO88696 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClppO88696 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClppO88696 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms