Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ComtO88587 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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ComtO88587 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ComtO88587 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ComtO88587 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ComtO88587 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ComtO88587 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ComtO88587 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ComtO88587 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ComtO88587 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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ComtO88587 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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ComtO88587 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ComtO88587 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ComtO88587 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ComtO88587 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms