Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vti1bO88384 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vti1bO88384 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms