Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms