Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cd46O88174 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd46O88174 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cd46O88174 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd46O88174 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd46O88174 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd46O88174 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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