Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RngttO55236 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RngttO55236 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RngttO55236 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms