Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms