Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms