Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx3O55144 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms