Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms