Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms