Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb2O55029 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms