Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms