Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh16O54909 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh16O54909 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh16O54909 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh16O54909 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh16O54909 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh16O54909 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Rdh16O54909 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rdh16O54909 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rdh16O54909 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rdh16O54909 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rdh16O54909 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16O54909 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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