Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms