Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb3O54890 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms