Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffbO54788 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffbO54788 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffbO54788 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffbO54788 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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