Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DffaO54786 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DffaO54786 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DffaO54786 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DffaO54786 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms