Protein–RNA interactions for Protein: O35980

Nthl1, Endonuclease III-like protein 1, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nthl1O35980 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms