Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek2O35942 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek2O35942 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms