Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emp3O35912 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms