Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccl25O35903 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms