Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sp100O35892 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sp100O35892 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sp100O35892 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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