Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CaluO35887 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CaluO35887 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CaluO35887 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CaluO35887 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CaluO35887 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CaluO35887 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CaluO35887 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CaluO35887 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CaluO35887 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CaluO35887 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms