Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms