Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NudcO35685 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NudcO35685 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NudcO35685 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NudcO35685 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NudcO35685 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NudcO35685 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NudcO35685 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NudcO35685 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NudcO35685 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NudcO35685 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NudcO35685 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NudcO35685 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NudcO35685 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NudcO35685 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NudcO35685 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NudcO35685 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NudcO35685 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NudcO35685 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NudcO35685 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms