Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms