Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc27a2O35488 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms