Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-ObO35424 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H2-ObO35424 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H2-ObO35424 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H2-ObO35424 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H2-ObO35424 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H2-ObO35424 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H2-ObO35424 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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